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Logiciel facturation freelance et auto-entrepreneur 2026

Pas le temps de jouer au comptable. Vous voulez émettre une facture en 30 secondes, encaisser, et passer à la suite. Mais vous voulez aussi être en règle avec la réforme 2026.

Par Sophie Renard13 min de lecture

La réalité du freelance : pourquoi les outils génériques ne marchent pas#

Vous êtes développeur, designer, consultant, rédacteur, formateur. Vous facturez vos clients. Vous ne pouvez pas vous permettre de passer 2 heures par semaine sur l'admin.

Le problème : la plupart des logiciels de facturation supposent que vous avez une compta compliquée. Vous, c'est simple : émettez une facture, suivez son paiement, exportez pour votre expert-comptable ou la CAE. C'est tout.

Et puis il y a la réforme de la facturation électronique : dès septembre 2026 vous devez pouvoir recevoir des factures électroniques, et émettre au format électronique au plus tard en septembre 2027. Votre logiciel doit vous préparer à ça — sans paniquer sur la TVA (voir plus bas, le seuil de franchise n'a pas été supprimé).

Pain points spécifiques aux freelances et auto-entrepreneurs#

Pain point 1 : Facturer en 30 secondes#

Vous avez une réunion client. Vous vous dites "je vais lui envoyer une facture avant ce soir". Vous n'avez pas 1 heure. Vous avez 5 minutes.

Un logiciel pour freelance, c'est ça : créer une facture en 30 secondes. Pas de modèle à remplir. Pas de paramétrage. Juste : montant, client, description, envoyer.

Pain point 2 : Suivre les paiements et les impayés#

Vous avez facturé 10 clients ce mois. Vous avez reçu 8 paiements. Qui doit vous payer encore ? À combien ?

Une bonne solution doit :

  • Vous afficher la liste des impayés
  • Vous permettre de relancer en 1 clic (mail template prérempli)
  • Vous calculer votre chiffre d'affaires réel (encaissé) vs théorique (facturé)

Pain point 3 : Respecter les seuils micro-entreprise#

Deux seuils à surveiller, à ne pas confondre : le seuil de franchise de TVA (de l'ordre de 37 500 € pour les services) au-delà duquel vous devez facturer la TVA, et le plafond du régime micro (77 700 € en services) au-delà duquel vous changez de régime fiscal et social.

Votre logiciel doit vous avertir quand vous vous approchez de ces seuils, et vous expliquer ce qui change (c'est pas rien).

Pain point 4 : Générer les déclarations URSSAF#

À chaque trimestre, vous devez déclarer à l'URSSAF votre CA. Si vous êtes au régime microl-social simplifié, c'est automatique. Sinon, c'est 2-3 clics dans votre logiciel : "Générer déclaration T1 2026".

Sans cela, vous appelez votre expert-comptable, qui charge 50 € pour remplir un formulaire. Pas utile.

Pain point 5 : Être conforme à la facturation électronique 2026#

À partir de 2026, il y a débat sur l'obligation de facturation électronique pour les micro-entreprises. Officiellement, elle commence pour les TPE (10 salariés+) et les PME (250 salariés+). Mais la tendance pousse à généraliser.

Votre logiciel doit pouvoir générer du Factur-X (XML structuré) si besoin. Pas de débat. Future-proof, c'est mieux.

Recommandations pour freelances et auto-entrepreneurs#

LogicielFactur-XMobileTarif
OnifyNotre recommandationTPE/PME, artisans, carrosserie, BTP, multi-sites
0 EURFree tier
IndyIndependants, professions liberales
32+ EUR/moFree tier
AbbyMicro-entrepreneurs
0 EURFree tier

Verdict 1 : Onify (le plus complet)#

Onify n'est pas un outil micro. C'est un ERP conçu pour croître avec vous.

Points forts :

  • Facture en 30 secondes (vraiment)
  • TVA gérée de manière transparente
  • Génération URSSAF et déclarations sociales automatisée
  • Factur-X natif pour le B2B
  • Suivi des paiements très clair
  • Export comptable impeccable
  • Relances automatisées (mail template + SMS possible)
  • Multi-devise si vous facturez à l'international

Points faibles :

  • Prix : 40-60 €/mois (cher pour un freelance solo)
  • Overkill si vous avez vraiment peu de clients
  • Nécessite une courbe d'apprentissage

Pour qui ? Freelances ayant 10+ clients actifs, 40 k€+ de CA annuel, ou prévoyant de croître.

Conseil : commencez avec Onify

Si vous savez que vous allez grandir (embauche prévue, CA croissant), autant commencer avec Onify dès le départ. Migrer d'Indy à Onify est lent et chiant. Mieux vaut surcharger au départ qu'améliorer après.

Verdict 2 : Indy (l'équilibre parfait)#

Indy est l'équilibre parfait pour un freelance classique : assez puissant, pas usine à gaz, prix accessible.

Points forts :

  • Facture ultra-simple (30 secondes vraiment)
  • Suivi des paiements très intuitif
  • TVA 2026 bien implémentée
  • Relances automatisées par mail
  • Mobile app bien faite
  • Prix : 25-40 €/mois
  • Export comptable compatible
  • Pas de complications inutiles

Points faibles :

  • Moins complet qu'Onify si vous avez besoin d'acomptes ou situations
  • Pas d'URSSAF généré automatiquement (vous le faites manuellement, ou via un outil tiers)
  • Fonctionnalités internationales limitées

Pour qui ? Freelances solo avec 5-50 clients, 20-60 k€ de CA annuel, pas de plans de croissance immédiat.

Verdict 3 : Abby (pour les vrais minimalistes)#

Abby, c'est l'outil minimaliste : une facture, c'est tout.

Points forts :

  • Gratuit
  • Facture en 1 minute
  • Interface extrêmement simple
  • Pas d'abonnement, pas de piège

Points faibles :

  • Zéro suivi des paiements
  • TVA 2026 pas vraiment gérée
  • Pas de relances
  • Pas de déclarations générées
  • Pas de mobile app

Pour qui ? Freelances avec peu de clients (< 5), CA faible, qui ont un expert-comptable qui gère tout en arrière-plan. Ou testeurs qui veulent essayer avant de payer.

Attention : gratuit ne veut pas dire sans risque

Abby est gratuit, mais ça veut dire que si le service ferme, vous avez perdu accès à vos factures. Préférez un logiciel payant avec une garantie de pérennité.

La réforme 2026 : ce qui change vraiment pour vous#

Facturation électronique : les vraies dates#

La réforme vous concerne, mais pas du jour au lendemain :

  • 1er septembre 2026 : vous devez pouvoir recevoir des factures électroniques (toutes les entreprises, micro comprises).
  • 1er septembre 2027 : vous devez émettre vos factures B2B au format électronique structuré (Factur-X, UBL ou CII), comme toutes les TPE et PME.

Pour vos clients particuliers (B2C), il s'agit d'un e-reporting des données de transaction, pas d'une facture électronique au même sens.

Franchise de TVA : ce qu'il faut savoir (et ne pas croire)#

Le projet de loi de finances 2025 prévoyait d'abaisser le seuil de franchise en base de TVA à 25 000 € pour toutes les activités. Face à la levée de boucliers des indépendants, la mesure a été suspendue. La franchise reste en vigueur avec ses seuils antérieurs (de l'ordre de 37 500 € pour les services).

Conclusion : ne facturez pas la TVA par défaut « parce que 2026 ». Vérifiez votre situation réelle sur impots.gouv.fr, et choisissez un logiciel qui gère la TVA proprement le jour où elle s'applique à vous.

Factur-X pour le B2B#

Si vous facturez des entreprises, votre logiciel doit savoir générer du Factur-X (PDF + XML structuré) à l'échéance d'émission (septembre 2027 pour les TPE/PME, micro comprises). Onify et Indy le proposent déjà. Mieux vaut un outil prêt que de migrer dans l'urgence.

Échéancier réel pour un freelance / micro
  • 1er septembre 2026 : obligation de pouvoir recevoir des factures électroniques.
  • 1er septembre 2027 : obligation d'émettre au format électronique (B2B).
  • Franchise de TVA : seuils antérieurs maintenus ; le projet de baisse à 25 000 € est suspendu — à surveiller dans les prochains budgets.
  • Vérifiez toujours votre seuil et votre statut sur impots.gouv.fr et autoentrepreneur.urssaf.fr.

Comparaison détaillée : Indy vs Tiime vs Henrri#

Trois petits logiciels pour freelances. Lequel choisir ?

CritèreIndyTiimeHenrri
Facture rapide✓✓✓✓✓✓✓
Suivi paiements✓✓✓✓✓
TVA 2026✓✓✓✓
Mobile app✓✓✓✓
Relances auto✓✓
Devis✓✓
URSSAF généréPartiellementOuiNon
Prix (mensuel)25-40 €Gratuit10 €
SupportBonMoyenBasique

Verdict rapide :

  • Indy : meilleur équilibre
  • Tiime : gratuit mais moins polished
  • Henrri : ultra-cheap mais limité

Pour la plupart des freelances, Indy est le choix par défaut.

Migration depuis un ancien logiciel ou Excel#

Si vous veniez d'Excel ou d'un vieux Facture+, voici le plan :

  1. Export des clients : CSV depuis votre ancien outil, import dans le nouveau. Facile.
  2. Historique des factures : Vous ne migrez pas les factures (elles sont archivées). Juste les factures ouvertes/impayées.
  3. Synchronisation compta : Le nouveau logiciel doit exporter un format que votre expert-comptable comprend (FEC, CSV compta, PDF). Tous les trois (Indy, Tiime, Henrri) le font.
  4. Relances : Vous ne relancez pas les vieilles factures (c'est trop tard). Vous partez zéro sur le nouveau logiciel.

Questions pratiques#


Récap : mon logiciel de facturation idéal pour freelance#

  • Facture ultra-rapide (30 secondes)
  • Suivi des paiements sans prise de tête
  • TVA 2026 bien gérée
  • Relances automatisées
  • Mobile app fonctionnelle
  • Export compta compatible
  • Factur-X (au moins optionnel)
  • Prix max 50 €/mois

Indy coche toutes les cases. C'est mon choix pour 90% des freelances.

Besoin de plus détails ? Consultez notre guide de la facturation électronique 2026 ou comparez les logiciels de facturation 2026.


Édité par : DYNAMIC WEB SAS. Société spécialisée dans les solutions de gestion pour les freelances, auto-entrepreneurs et indépendants.

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